ゲノム情報科学研究教育機構  アブストラクト
Date July 23, 2008
Speaker Prof. 西岡 孝明(慶應義塾大・先端生命科学研究所)
Title 代謝物質のマススペクトルデータベース MassBank
Abstract  植物や微生物が生合成している、生理活性を有する2次代謝物質(生理活性天然物)の多くは、種に特異的であることや複雑な化学構造をしているため、生合成経路は未知であり、その予測も難しい。さらに生理活性(あるいは薬効)の ontology が未整備である。このように生理活性天然物はゲノム情報などの bioinformatics resource から取り残されている。
 2次代謝物質や代謝中間体の網羅的化学分析・化学構造の自動同定を目的として、天然物のマススペクトルデータベース MassBank の構築を2006年から始めた。このデータベースの概念、特徴、現状について紹介するとともに、JST-BIRD の研究課題として実施している、代謝反応の知識に基づいた2次代謝物質の化学構造式の系統的分類、生物種の系統的分類と生合成経路の関係、などの研究についても簡単に紹介する。
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